据《珠海市综合交通枢纽布局规划及重点枢纽交通详细规划》，珠海市将建设七条城市轨道线（地铁）和两条城际轨道线路。
珠海地铁1号线的首末站为九洲港站和金湾枢纽西站，线路全长36.3公里。项目东起九洲港码头，途经九洲大道，穿越前山河，并沿珠海大道方向在洪湾涌西路左拐，随后与港珠澳大桥珠海连接线相接，再驶向洪湾渔港方向，穿越磨刀门水道和泥湾门水道，西至金湾航空新城的金湾枢纽西站。
珠海地铁2号线的首末站为金鼎西站和拱北口岸站，线路全长33公里。项目南起珠海拱北口岸站，往北沿迎宾路，与珠海地铁1号线在九洲大道中交会，随后穿越板障山，途经紫荆路、人民路、港湾大道和情侣北路，终点为金鼎西站。
珠海地铁3号线拟为南北走向，首末站分别设在横琴自贸区和斗门白藤湖区域。项目以横琴自贸区为起点，经过鹤州南，经过三灶、金湾区人民医院、金湾区体育中心、航空新城西侧、珠海大道、然后穿过西湖中心A区、到达珠峰大道西侧、最终落位于湖心路与尖峰大桥交接处。
珠海地铁4号线自横琴口岸出，沿环岛路向北进入金融岛并向西延伸至国际居住区，再经保税区通道跨马骝洲水道进入一体化发展区核心区，此后向西南方向延伸并再次跨越马骝洲水道至横琴高新产业园区，跨越磨刀门水道后向西连接鹤州和金湾地区。
珠海地铁5号线为金湾枢纽至富山站，属于远期规划项目。
珠海地铁6号线为白藤头至鹤州南，属于远期规划项目。
珠海地铁7号线为斗门井岸至鹤州南，属于远期规划项目。
珠机城轨，全名珠海市区至珠海机场城际轨道交通线，是一条兼顾城市轨道交通功能的城际轨道线，远期拟由广州地铁集团负责运营。
广州地铁18号线是广州地铁正在建设的线路之一，定位为南北跨市快线，采用最高时速160公里的列车，未来将有望从广州万顷沙站沿湾区向南经中山翠亨后接入珠海北站，继续向南接入拱北和横琴口岸，在横琴口岸与澳门轨道交通连通。
