2012年，交科院开展了交通运输软科学、信息化、环保与安全、城市交通、工程技术以及标准计量、检测认证等科学研究与技术服务工作，为部科学决策、部机关履行职能、行业科技创新发挥了重要的支撑和保障作用。
2013年，面对交通运输发展的新形势新任务，交科院将坚持“为部服务、为行业服务”，走质量效能型发展道路，发挥自身优势与特点，重点做好交通运输发展战略、政策创新、技术创新等研究工作，为推进交通运输现代化作出积极贡献。
一是发展战略研究。进一步深入研究交通运输的基本属性，强化对交通运输先导性的研究，为交通运输“适度超前”发展提供理论依据。在新形势下，继续坚持发展现代交通运输业的总体战略，需进一步丰富和完善现代交通运输业的内涵和特征，深化研究“现代交通运输业发展评价指标体系”，研究提出“全面建成小康社会交通运输发展目标”，深化对交通运输现代化发展路径的研究工作。
二是政策创新研究。继续加强“两个公路体系”的相关研究工作，研究构建支撑普通公路建设和管养的投融资体制等。开展“交通运输对GDP增长、财政税收、劳动就业等经济社会发展贡献研究”工作，以可视、可测、可控的指标反映交通运输发展成果及对国家或地区经济社会发展的贡献水平，研究将其列入对一个地区交通运输工作和领导干部业绩的考核评价的科学性与合理性。
三是技术创新研究。继续加强基础性、前瞻性、关键性科技研发工作，做好物联网技术、港口物流枢纽建设与运营技术、低碳交通城市评价技术、旅游公路建设技术等研究工作；做好信息资源共享平台、环保型融雪剂、自调温沥青混合料等技术推广工作，推动交通运输信息化、运营、管理、材料等技术创新，不断增强交通运输行业的创新发展新动力。
